Naprawa manualnej skrzyni biegów jest trudnym zadaniem dla domowego mechanika. Oprócz demontażu i montażu należy dokładnie zmierzyć luzy i w razie potrzeby wyregulować je poprzez dobór podkładek. Części układu przeniesienia napędu często trudno nabyć osobno, a w wielu przypadkach są one niezwykle drogie. Z tego powodu, jeśli skrzynia biegów jest uszkodzona lub hałasuje, lepiej wymienić jednostkę, zlecić jej naprawę specjaliście lub wymienić jednostkę.
Jednak bardziej doświadczony mechanik jest w stanie samodzielnie naprawić skrzynię biegów, jeśli ma dostęp do specjalistycznych narzędzi i wykonuje pracę stopniowo, aby niczego nie pominąć.
Narzędzia potrzebne do ponownego montażu: szczypce do pierścieni osadczych, ściągacze łożysk, młotek ślizgowy, zestaw precyzyjnych wybijaków, wskaźnik kontrolny i ewentualnie prasa hydrauliczna. Ponadto duży i solidny stół warsztatowy oraz imadło.
Podczas rozbierania skrzyni biegów należy zwrócić szczególną uwagę na sposób montażu każdego podzespołu, aby umożliwić łatwy i dokładny ponowny montaż.